[python] python으로 ipynb파일 수정하기

fingerprint 5개와 assay37개를 변경해가면서 모델을 학습해야하므로 ipynb파일의 특정부분을 수정하여 185개의 ipynb파일을 손쉽게 만들수 있는 코드를 작성했다. 하나하나 수정하면서 실행하려면 힘드니 미리 코드를 짜서 수정해 놓고 실실행만 시키도록 하자. 

 

#fingerprint 리스트
fp_list = ['maccs','morgan','pattern','rdkit','layerd']

#어세이 그룹과 그룹안 어세이 개수
group_dict = {'8305' : 13,
              '7871' : 16,
              '7521' : 8
             }
               
for group in group_dict : 
    print(group)
#8305
#7871
#7521

#그룹, 어세이, fingerprint 수정하여
#.ipynb 파일 37(assay)개수*5개(fingerprint개수) 만들기

file_name = 'MACCS_8305_0.ipynb'
for fp in fp_list : 
    for group in group_dict : 
        for i in range(group_dict[group]) : 
            f = open(file_name,'r',encoding='UTF8')
            file = f.readlines()
            f.close()
            file[10] = file[10].replace("8305",str(group))
            file[11] = file[11].replace("0",str(i))
            file[12] = file[12].replace("maccs",fp)
            
            g = open('./create_models_cv_result/'+fp+"_"+str(group)+"_"+str(i)+".ipynb", 'w+',encoding='UTF8')
            g.writelines(file)
            g.close()
    
#끝