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[COLAB] google colab 이란? & 사용법 google colab & jupyter notebook • 구글 코랩(colab)은 클라우드 기반의 무료 Jupyter notebook 개발 환경 • google drive에 저장된 jupyter notebook • 내부적으로 코랩 + 구글드라이브 + 도커 + 리눅스 + 구글클라우드의 기술스택으로 이루어진 것으로 알려짐 • jupyter notebook은 python을 실행할 수 있는 IDE(통합개발환경)의 일종 • pycharm, vscode에 비해 웹브라우저에서 동작할 정도로 가벼움 • 데이터과학, 머신러닝 프로젝트에 많이 사용되는 개발환경 • anaconda(여러 데이터분석 패키지를 포함한 파이썬 배포판) 설치시 jupyter notebook, lab이 함께 설치됨 • cmd,bash 등 에서 j..
[Windows] cmd에서 사용되는 프로세스 kill명령어 머신러닝모델을 만드느라. python을 주로 사용하는데 shell에서 jupyter notebook을 켜고 특정 파일을 open해 두었다. 그 후에 shell을 닫았는데 여전히 python이 실행중이여서 open해 둔 파일이 삭제가 안 되는 것이다. 그래서 삭제하기 위해서 python을 kill하는 방법을 찾아보았다. 윈도우에서 사용하는 프로세스 kill 명령어는 takkill이다. cmd를 켜고 taskkill /im 이미지프로세스 이름 ---> 이렇게 입력하면 원하는 프로세스를 죽일 수 있다. takkill /im python --> 이렇게 하니 python 이 kill되어서 파일을 삭제할 수 있었다. 참고로 taskkill /pid 종료할 pid --> 이렇게 프로세스 id로도 kill할 수 있다.
[python] python으로 ipynb파일 수정하기 fingerprint 5개와 assay37개를 변경해가면서 모델을 학습해야하므로 ipynb파일의 특정부분을 수정하여 185개의 ipynb파일을 손쉽게 만들수 있는 코드를 작성했다. 하나하나 수정하면서 실행하려면 힘드니 미리 코드를 짜서 수정해 놓고 실실행만 시키도록 하자. #fingerprint 리스트 fp_list = ['maccs','morgan','pattern','rdkit','layerd'] #어세이 그룹과 그룹안 어세이 개수 group_dict = {'8305' : 13, '7871' : 16, '7521' : 8 } for group in group_dict : print(group) #8305 #7871 #7521 #그룹, 어세이, fingerprint 수정하여 #.ipynb 파일 37(a..
[Network] The Internet : Crash Course Computer Science #29
[Network] The client Server Model
[AI 독성예측] rdkit에서 사용할 수 있는 molecular Descriptor에 대하여 www.rdkit.org/docs/GettingStartedInPython.html#descriptor-calculation Getting Started with the RDKit in Python — The RDKit 2020.09.1 documentation [$([O,S;H1;v2;!$(*-*=[O,N,P,S])]),$([O,S;H0;v2]),$([O,S;-]),$([N;v3;!$(N-*=[O,N,P,S])]),n&H0&+0,$([o,s;+0;!$([o,s]:n);!$([o,s]:c:n)])] www.rdkit.org www.rdkit.org/docs/GettingStartedInPython.html#list-of-available-descriptors Getting Started with the ..
[Colab]21.02.24자 colab에서 Rdkit 설치안되는 문제해결하기 저는 화학물질데이터를 다루는 일을 하고 있기 때문에 rdkit이라는 python libaray를 자주 사용합니다. 그런데 어제까지는 colab에서 잘 설치되던 rdkit이 오늘자로 갑자기 설치에 오류가 뜨는 것을 발견했습니다. 아마도 colab이 업데이트 되면서 vm의 설정이 조금 바뀐것 같습니다. 기존에 colab에서 rdkit을 설치하는 여러가지 방법이 있는데 모두 시도를 해보았지만 잘 되지 않았습니다. 기존내가 썼던 방법들 # rdkit 2020.03.3 버전 다운로드 !pip install kora -q import kora.install.rdkit # rdkit 2020.03.3 버전 다운로드 # !pip install kora -q # import kora.install.rdkit import..
[ChemDSRC] 클라우드이용 계획 1. Google Colab Pro colab.research.google.com/signup Colab Pro colab.research.google.com Google Colab은 AI개발자들을 위해 구글에서 제공하는 무료 클라우드 서비스로써 jupyter 노트북 개발 환경을 제공합니다. 내부적으로는 코랩 + 구글드라이브 + 도커 + 리눅스 + 구글클라우드의 기술스택으로 이루어진 것으로 알려져 있습니다. Colab Pro는 월 9.99$의 가격으로 더 빠른 GPU 및 TPU에 우선적으로 엑세스 할 수 있는 서비스를 제공합니다. 더 긴 런타임을 제공하며 연결이 끊기는 빈도가 낮아집니다. 또 더 큰 RAM과 디스크 용량을 제공합니다. COLAB PRO SPEC CPU : Intel Xeon 2.3GHz ..

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