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[AI독성예측]Best model for predicting toxcast bioactivity Best model for predicting toxcast bioactivity Toxcast 데이터셋 수백개 bioassay의 활성/비활성을 예측하는데 있어서 최근 GNN기반 모델들이 좋은 성능을 보여주고 있다. Paperswithcode는 여러 도메인에 대한 최신 연구 트렌드를 정리해놓은 유용한 웹사이트인데 이곳에서 Toxcast assay 예측 모델의 순위와 성능, 모델에 대한 논문과 source code를 확인할 수 있다. Leaderboard에는 등록되어 있진 않지만 2020년에 출판된 논문 Xiong et al 에서 제안된. Attentive FP모델은 toxcast에서 0.805수준의 AUC 를 보여준다 이는 TrimNet보다 약 0.023 높은 수치이다. Attentive FP모델을 포함..
[머신러닝] Multiclass and multioutput algorithms(multitask learning) scikit-learn.org/stable/modules/multiclass.html 1.12. Multiclass and multioutput algorithms — scikit-learn 0.24.1 documentation 1.12. Multiclass and multioutput algorithms This section of the user guide covers functionality related to multi-learning problems, including multiclass, multilabel, and multioutput classification and regression. The modules in this section implement meta- scikit-learn...
[논문분석] Pushing the Boundaries of Molecular Representation for Drug Discovery with the Graph Attention Mechanism toxcast에서 0.805수준의 AUC 를 보여준 논문. ABSTRACT: Hunting for chemicals with favorable pharmacological, toxicological, and pharmacokinetic properties remains a formidable challenge for drug discovery. Deep learning provides us with powerful tools to build predictive models that are appropriate for the rising amounts of data, but the gap between what these neural networks learn and what human beings can..
[ChemDSRC] 환경성질환 예측 과제 활용내용 생각해보기 news.v.daum.net/v/20210417072509862 고창 시골 마을에 무슨 일이?..주민 50여명 중 18명 암 발병 (고창=연합뉴스) 정경재 기자 = 전북 고창군 시골 마을 주민 십수 명이 원인 모를 암과 오랜 시간 사투를 벌이고 있다. 주민들은 인근 퇴비공장에서 새어 나온 오염 물질을 발암 요인으로 의심하 news.v.daum.net 어제 얘기한 이번에 시작한 환경부 환경성질환 예측 과제의 실제 정책적 활용 목적이 딱 이런 상황이 발생했을때 활용하기 위함입니다. 어떻게 해볼 수 있을지 각자 생각해보세요 news.v.daum.net/v/20210417090112761 "남양유업의 무리수가 빚은 참사"..식품업계가 발칵 뒤집혔다 [박종관의 食코노미] 남양유업이 섣부른 '코로나19 마케팅'으로..
[Dacon] Bit trader season 2 ppt coin_index open high low close volume quote_av trades tb_base_av tb_quote_av
[데이터마이닝] 추천시스템 3.0:딥러닝 후기시대에서바이어스, 그래프, 그리고 인과관계의중요성 deview.kr/2020/sessions/356 추천시스템 3.0: 딥러닝 후기시대에서 바이어스, 그래프, 그리고 인과관계의 중요성 발표자 : 김경민, 곽하녹, 박영진, 김민규 deview.kr 추천시스템은 기존 딥러닝 (ex>CNN, RNN)을 사용하여 성능을 크게 올릴 수 있었지만 딥러닝의 한계로 추천시스템의 또한 한계가 분명히 존재했습니다. 이 세션에서는 기존 추천시스템을 버전 2.0으로 정의하고, next step의 추천시스템에서 어떤 기술들이 중요한지 LINE Wallet 추천시스템 사례중심으로 얘기합니다. 첫번째로 LINE Wallet tab의 UI추천을 사례로 bias reduction을 얘기합니다. UI추천은 big data를 활용할 수 있는 환경을 갖추고 있지만 데이터속 bias때문에 ..
[AI독성예측] ToxCast란? Toxicity Forecaster (ToxCast) 미국 환경보호청(EPA)는 이러한 물질들의 잠재적인 독성 효과를 평가하고 식별하기 위해 ‘실험실 독성 테스트(ToxCast)’를 사용해 왔다. ToxCast란 살아있는 세포, 단백질, 또는 생물학적 분자를 화학물질에 접촉시킨 후 변화를 관찰하는 검사법이다, toxcast는 1473개의 assay에 대한 데이터가 존재. assay : 특정 유전자를 타겟으로 하는 어세이 독성 반응과 관련돼 있다고 여겨지는 단백질. receptor에 의한 ligand로 agonist라면 그건 receptor에 ligand와 같이 binding도 하고 receptor activation까지 할수 있는것을 말하고 즉 original ligand와 비슷하게 행동하는 물질이란 뜻..
[논문분석]Relational Pooling for Graph Representations